虽说地水源热泵机组的好处多多，但是用户在选择地源热泵时一定要注意一下几点，确保后期地源热泵能够稳定的运行。
首先是建筑冷热负荷的计算，这与机组的选型有关，若是机组负荷过大，就会导致地源热泵耗电量增大，若是机组负荷选择过小，那么就会造成冷热温度无法实现，无论是哪种状况在后期的使用过程中都会给用户造成一定的困扰。
再一个就是水源热泵机组的冷热负荷不平衡的问题，这个问题主要凸显在冷热负荷不均的地区，如果地源热泵机组冬季向地下取热与夏季向地下散热不均与，那么系统长时间的运行就会导致地下土壤温度的改变，最终导致冷却水温度的改变，长此以往地源热泵系统的效率也会逐年下降。